El enfoque de Ubuntu en el escritorio es habilitar la cuenta del usuario para utilizar sudo/gtksudo con cualquier mandato, que ahí probablemente es más cómodo para el usuario y creo que está bien. En un servidor lo que haces es utilizar sudo también, pero del modo que describo en el manual de sudo. Es decir, activas solo ciertos mandatos a ciertos usuarios sin otorgarles más privilegios de los que se necesitan.

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Joel Barrios Dueñas.
Director General Alcance Libre, A.C.
http://www.AlcanceLibre.org/
La libertad del conocimiento al alcance de quien la busca.