En muchas ocaciones y dependiendo por supuesto del cliente, se usan diferentes bases de datos en los desarrollos, en el mundo del Software Libre creo que lo mas usado es MySQL y PostgreSQL  y en el mundo del Softtware propietario creo que lo mas usado es SQL Server, Sybase, Oracle. Como yo desarrollo en Windows me he encontrado WinSQL

Hay tres versiones: Lite, Developer, Professional. La versión Lite es gratuita, pero es necesario registrarse en el sitio del fabricante y obtener una clave. Pero para mi ha sido suficiente despues de trabajar en línea de comando. Su interfase me recuerda mucho al isqlw del viejo SQL Server 6.5 donde en 1992 comencé a trabajar como programador.

Pueden obtenerlo de AQUI